Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATF1P18846 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATF1P18846 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATF1P18846 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATF1P18846 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATF1P18846 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms