Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALM2P0DP24 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms