Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTA1P02549 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms