Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FCHSD2O94868 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FCHSD2O94868 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms