Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP104O60308 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP104O60308 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP104O60308 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms