Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3O43889 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3O43889 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms