Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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