Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA2O43364 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms