Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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