Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms