Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C5orf58C9J3I9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C5orf58C9J3I9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms