Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms