Protein–RNA interactions for Protein: A6NNB3

IFITM5, Interferon-induced transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM5A6NNB3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFITM5A6NNB3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFITM5A6NNB3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms