Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HMX3A6NHT5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms