Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NOP16Q9Y3C1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms