Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms