Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms