Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM35Q9UPQ4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms