Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC4AQ9UMR7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms