Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPMQ9NSP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms