Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLSPNQ9HAW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms