Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms