Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIRIP3Q9BW71 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIRIP3Q9BW71 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms