Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPOQ9BU64 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPOQ9BU64 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms