Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPA33Q99795 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPA33Q99795 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms