Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX2Q99697 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms