Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC107Q8WV48 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms