Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NME9Q86XW9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms