Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD3Q7L5L3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms