Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMBOX1Q6NT76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms