Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SAPCD1Q5SSQ6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAPCD1Q5SSQ6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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