Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEXMIFQ5QGS0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEXMIFQ5QGS0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms