Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RFTN2Q52LD8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms