Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms