Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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