Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBBP7Q16576 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms