Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDSNQ15517 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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