Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SIX1Q15475 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SIX1Q15475 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIX1Q15475 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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