Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CYTH1Q15438 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYTH1Q15438 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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