Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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