Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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