Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RPS27-204ENST00000493224 573 ntTSL 220.89■□□□□ 0.938e-31■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.228e-31■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 HDGF-207ENST00000477306 686 ntTSL 217.8■□□□□ 0.448e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.148e-8■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 310.53□□□□□ -0.728e-8■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 ABHD16A-207ENST00000475742 1319 ntTSL 518.3■□□□□ 0.528e-9■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.278e-9■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 ABHD16A-204ENST00000468205 913 ntTSL 214.81□□□□□ -0.048e-9■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-14■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 EMG1-201ENST00000539196 616 ntTSL 27.14□□□□□ -1.272e-14■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 RPS8-203ENST00000464658 898 ntTSL 211.25□□□□□ -0.618e-50■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.34e-6■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-11■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.96e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.086e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 RPL17-216ENST00000582935 469 ntTSL 213.8□□□□□ -0.21e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-7■■■□□ 14.7
PABPC4Q13310 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 521.85■■□□□ 1.092e-30■■■□□ 14.7
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PABPC4Q13310 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-12■■■□□ 14.6
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PABPC4Q13310 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.883e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SIGMAR1-202ENST00000353468 1582 ntTSL 1 (best)23.1■■□□□ 1.293e-7■■■□□ 14.6
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PABPC4Q13310 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 418.09■□□□□ 0.496e-20■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-20■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 214.99□□□□□ -0.016e-20■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 412.68□□□□□ -0.386e-20■■■□□ 14.6
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PABPC4Q13310 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.126e-20■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.556e-20■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 523.1■■□□□ 1.295e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BUD23-212ENST00000453316 452 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BUD23-215ENST00000471215 3886 ntTSL 210.96□□□□□ -0.655e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PKN1-213ENST00000591461 867 ntTSL 317.4■□□□□ 0.387e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 53.78□□□□□ -1.84e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.771e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.411e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 316.8■□□□□ 0.281e-16■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TIMM50-219ENST00000602265 786 ntTSL 216.57■□□□□ 0.244e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SERF2-208ENST00000409617 700 ntTSL 217.47■□□□□ 0.395e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SERF2-213ENST00000448830 2792 ntTSL 214.78□□□□□ -0.045e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 517.32■□□□□ 0.363e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-219ENST00000592604 2940 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.173e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-208ENST00000585799 3842 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.457e-11■■■□□ 14.6
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