Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CALCOCO2Q13137 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CALCOCO2Q13137 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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