Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GPS1Q13098 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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