Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC20Q12834 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms