Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC173Q0VFZ6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms