Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms