Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms