Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEUP1Q05D60 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEUP1Q05D60 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms