Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN12Q05209 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN12Q05209 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN12Q05209 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms